類澱粉蛋白（Amyloid beta）堆積被認為是阿茲海默症等神經退化性疾病的重要病理機制，科學家發現，人類腦部的類澱粉蛋白沉積與腸道菌群有密切關聯，其背後的原理與「腸腦軸」密切相關。
腸道菌影響認知功能及情緒？
類澱粉蛋白沉積的成因與腸道菌的影響
國泰醫院老人醫學科主任黃柏堯表示，類澱粉蛋白是腦內一種異常折疊的蛋白質，其沉積會導致神經元功能受損，進而影響認知能力，過去科學家的研究，大多著墨於腦中如何會沈積類澱粉蛋白、又或是如何影響大腦功能，後來才逐步思考，這種不該出現在腦部的「異常蛋白」，怎麼會跑到腦中？
黃柏堯表示，類澱粉蛋白是一種不可溶的纖維蛋白，較常出現在腸胃道中，部分腸道菌可產生類澱粉蛋白樣的物質，像是腸道中以大腸桿菌為首的腸道菌族群會製造類澱粉酶，用來增加菌叢自身的穩固性，並減少被人體免疫系統攻擊消滅的機會，而過量的腸道菌類澱粉酶卻會引發全身性免疫系統的活化，連帶增強大腦神經細胞的類澱粉酶製造與沉積，提升罹患阿茲海默症風險。
研究顯示：巴金森氏症患者
腸道內異常蛋白多
腸道菌與腦部連接的路徑中，其中包含「迷走神經」，研究發現類澱粉蛋白極可能透過迷走神經，觸發腦部類澱粉蛋白聚集，過去研究發現，罹患巴金森氏症患者腸道內含有較多這類異常蛋白，顯示腸道可能是神經退化疾病的起點之一。
巴金森氏症是僅次於失智症第二常見的疾病，60歲以上的盛行率約為1%～2%，後續會隨著年齡增長盛行率增加。而失智症中，最為常見的仍為「阿茲海默症」。
國際知名醫學期刊《科學轉化醫學》曾刊登一份研究，美國聖路聖易華盛頓大學研究團隊招募164名受試者，其中有49名受試者具早期阿茲海默症症狀、115人為認知正常的受試者，兩組人在受試期間飲食狀況相似，但患者組的腸道菌與微生物功能，與健康組有顯著差異。
雖然該研究並未針對類澱粉蛋白做進一步觀察與研究，但阿茲海默症患者的腸道菌叢，在早期出現症狀時，就已經出現變化，與健康組出現差異。
不只有腸漏症 腸腦軸還可能出現「腦漏症」
大腦一直具有極為強大的保護機制，被稱為「血腦屏障」，許多人體服用的藥物，無法透過口服進入血液之後抵達大腦，需要讓血腦屏障開啟，才有機會讓藥物進入，而如何開啟血腦屏障，一直是醫學界苦惱的課題。
黃柏堯說，但從腸腦軸的理論不斷被證實，加上失智症與腸道菌研究發現，腸道菌可從迷走神經與大腦連結突破血腦屏障，成為未來治療失智症或是其他疾病的契機，不過，也因為腸腦之間的連結能打破屏障，如果腸道不夠健康，增加免疫細胞激素與毒素影響腦部的機會，造成「腦漏症」。
近年有國外的研究發現，一旦引起人體出現腸漏症狀的「腸黏膜細胞分泌解連蛋白」（zonulin）上升，大腦血腦屏障的通透性也會上升，長久以來容易腦霧、記憶力下降，也容易因為情緒狀況不佳，而導致失眠等問題。黃柏堯說，腸道是人體製造血清素最多的地方，腸道菌叢失衡，就會影響血清素、多巴胺等神經傳導物質生成，當血清素、多巴胺的量不足，已被證實會增加憂鬱症、焦慮症等情緒障礙風險。
養好腸道 有機會降低類澱粉蛋白沈積
黃柏堯表示，從各項研究指出，腸道與腦部具有一定的關聯，若腸道養好就有機會降低罹患腦部疾病風險，幫助腸道菌叢平衡可從飲食著手，如多攝取膳食纖維、多吃發酵食品，減少吃高油高糖食物，另外也應該要降低使用抗生素，避免殺死腸道細菌，以及平時應維持正常生活作息，睡眠充足以及降低生活壓力。
目前科學界也嘗試採取移植好的腸道菌到人體，又或是透過益生菌增加腸道平衡的機會、搭配藥物等方式，達到改善疾病的效果。